Одним из важнейших направлений деятельности ВНИИГ им. Б.Е. Веденеева является международное сотрудничество. Институт участвует в научном обосновании проектирования и строительства ряда объектов в странах ближнего и дальнего зарубежья. Специалисты института, являясь членами международных научных организаций, ведут работу по обмену опытом с зарубежными партнерами.
По профилю своей деятельности институт связан с рядом международных научных организаций, среди которых:
ВНИИГ является базовой организацией Российского национального комитета (РНК) МАГИ, 12 сотрудников ВНИИГ — члены РНК МАГИ. Совместно с МАГИ ВНИИГ провел на своей базе Международный симпозиум «Гидравлические и гидрологические аспекты надежности и безопасности гидротехнических сооружений» (2002 г.), Международный симпозиум по льду (2004 г.) и 75-е Ежегодное Собрание Международной Комиссии по большим плотинам в июне 2007 г.
11 сотрудников института входят в состав РНК по большим плотинам, а 4 являются членами технических комитетов СИГБ.