С началом войны в ряды Красной Армии было мобилизовано более 50 сотрудников ВНИИГ. Знания и опыт высококвалифицированных специалистов, имевших прекрасную научную и инженерную подготовку во всех областях строительства, были нужны стране. Сотрудники института не только воевали на фронте, но и руководили работами по возведению оборонительных сооружений, консультировали по этим вопросам Инженерное управление Ленинградского фронта. Под их руководством строились противотанковые рвы, окопы, ДЗОТы, узкоколейные железные дороги, проводились всевозможные ремонтные работы на линии обороны. Все сотрудники, работающие в отрядах военно-полевого строительства, впоследствии получили воинские звания.
В 1942 г. большая часть научного состава ВНИИГ была эвакуирована в Ташкент и Чирчик Узбекской ССР, где институт смог продолжить свою работу. В 1944 г. после полного снятия блокады институт вернулся в Ленинград.
На выставке, приуроченной к 75-летию Победы в Великой Отечественной войне, представлены фотодокументы и архивные материалы, связанные с историей института в период Великой Отечественной войны. Это фронтовые портреты сотрудников института, документы — свидетельства блокадного и военного времени, награды, научные труды.